Debido al clima de la región es muy poca la variedad de especies animales que en ella se encuentran. Muchas de estas especies se encuentran en vía de extinción ya que los habitantes de estas tierras han encontrado como único modo de supervivencia la caza de animales (como los manatíes y la guartinaja). Entre los animales más predominantes se encuentran el tigrillo, el mico tití, la guacamaya y varias especies de serpientes. Cabe destacar que también en nuestros mares se encuentran especies como el bocachico, muy consumido en la Costa y el caimán que en estas aguas es uno de los más grandes que existen. 

La flora de la región es también poco exótica,[cita requerida] aunque existen especies únicas como el manglar que en la región se encuentra en grandes cantidades. En los páramos de la Sierra Nevada se encuentran también frailejones. En los mares y en especial en las Islas de Nuestra Señora del Rosario cerca de Cartagena donde se encuentran grandes arrecifes de coral que contribuyen al embellecimiento del ecosistema. 

Al ser un país de trópico ubicado en la zona del ecuador, Colombiatiene una gran representación de grupos taxonómicos en fauna y flora típica del área, a la que se suman variedades de migraciones de fauna desde distintas partes del planeta; por la variedad de ecosistemas.